En sus diversos salones de exposición podemos hacer una recorrido histórico de los distintos hitos de la Armada de Chile hasta la nuestros días. Como las campañas en la Independencia y la Guerra del Pacífico, dentro de la colección destaca: la mesa de la cámara de oficiales de la fragata española Reina María Isabel, parte del uniforme de guardiamarina de Arturo Prat, los Mascarones de Proa de la Corveta Esmeralda. Este último, ubicado en uno de los patios del Museo, junto con cañones y otro armamento de época. Se puede acceder desde el ascensor artillería, las visitas a público son de martes a Domingo desde las 10:00 a 18:00 hrs.